论文查重软件中的智能语义分析功能主要包括：基于语义相似度的查重、基于语义分析的抄袭检测、基于语义分析的文本比对等。基于语义相似度的查重是指通过对文本进行语义分析，计算文本间的相似度，从而判断是否存在抄袭行为。基于语义分析的抄袭检测则是通过对文本进行语义分析，将文本分解为语义单元，再进行抄袭比对。基于语义分析的文本比对则是将文本进行语义分析，将文本分解为语义单元，再进行文本比对，从而判断文本的相似度。

智能语义分析功能在论文查重软件中的应用，可以有效地提高查重的准确性和效率。通过对文本进行语义分析，不仅能够判断文本的相似度，还能够识别出一些近义词、同义词等，从而避免了简单的词汇替换所带来的误判。此外，智能语义分析功能还能够识别出文本中的关键信息，从而帮助用户更加准确地把握文本的核心内容，有助于提高论文的质量和水平。